Deltamicron: Delta-Omicron rekombinant med hybridgenom  

Fall av samtidiga infektioner med två varianter har tidigare rapporterats. Inte mycket var känt om viral rekombination som gav virus med hybridgenom. Två nyare studier rapporterar fall av genetisk rekombination bland SARS-CoV-2-varianter Denta och Omicron. Rekombinanten, kallad Deltamicron, hade egenskaper hos båda varianterna.  

Termen "Deltacron" dök upp tidigt i år¹ to denote COVID-19 cases of co-infection of people with the different variants of SARS-Cov-2 variants, e.g. delta and omicron. Delmicron or Deltacron referred to the infection caused by a combination of “two variants of the same strain of virus, SARS CoV-2″, and were not said to be different “stammar".  

However, cases of genetic recombination between two different strains of SARS-CoV-2 have been reported recently. On 08 March 2022, researchers² rapporterade tre infektioner i södra Frankrike med "Deltamikron" rekombinant med hybridgenom som hade spikprotein från en Omicron-variant och "kroppen" av en Delta-variant. Hybridgenomet hade signaturmutationer av de två linjerna. Den rekombinanta spiken kan optimera viral bindning till värdcellmembranet.  

Evidences for Delta and Omicron recombination has emerged from USA³ också. Detta team kunde identifiera två oberoende fall av Delta-Omicron rekombinant. I båda fallen var 5'-änden av det virala genomet från Delta-genomet och 3'-änden från Omicron.  

It is suggested that the recombinant viruses are not common nor there is any evidence to suggest that the recombinants with hybrid genomen are more transmissible or virulent than the dominant circulating variants.  

***

Referenser:  

1. Deltacron är inte en ny stam eller variant. Vetenskaplig europeisk. Upplagt 9 januari 2022. Finns på http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/  

2. Colson, P., et al, 2022. Kultur och identifiering av en "Deltamikron" SARS-CoV-2 i ett kluster med tre fall i södra Frankrike. Förtryck medRxiv. Upplagt 08 mars 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812  

3. Bolze A., et al, 2022. Bevis för SARS-CoV-2 Delta och Omicron samtidiga infektioner och rekombination. Förtryck medRxiv. Upplagt 12 mars 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113 

***