Coronavirus är RNA virus tillhör familjen coronaviridae. Dessa virus uppvisar anmärkningsvärt höga felfrekvenser under replikering på grund av brist på korrekturläsande nukleasaktivitet hos deras polymeraser. I andra organismer korrigeras replikationsfelen men koronavirusen saknar denna förmåga. Som ett resultat förblir replikeringsfel i koronavirus okorrigerade och ackumuleras vilket i sin tur fungerar som en källa till variation och anpassning i dessa virus. Således har det alltid varit sakens natur att koronaviruset genomgår mutationer i sina genom i extremt höga hastigheter; mer överföring, fler replikationsfel händer och därmed fler mutationer i genomet som leder till fler varianter följaktligen.
Självklart byter man till nytt varianter är inte ny för coronavirus. Mänsklig coronavirus har byggt upp mutationer till nya former i den senaste historien. Det var flera varianter ansvarig för olika epidemier sedan 1966, då det första avsnittet spelades in.
SARS-CoV var den första dödliga varianten som orsakade coronavirus epidemi i Guangdongprovinsen i Kina 2002. MERS-CoV var nästa viktiga variant som orsakade epidemi i Saudiarabien 2012.
Novellen coronavirus SARS-CoV-2, varianten ansvarig för den nuvarande COVID-19-pandemin som startade i december 2019 i Wuhan, Kina och som därefter spreds över hela världen för att bli den första coronavirus pandemi i mänsklighetens historia, har kontinuerligt genomgått ytterligare anpassning, ackumulerande mutationer i olika geografiska regioner, vilket ger upphov till flera sub-varianter. Dessa under-varianter har mindre skillnader i deras genom och spikproteinerna och visar skillnader i deras överföringshastighet, virulens och immunflyktsinfektionsförmåga.
Baserat på hotet som dessa undervarianter utgör, grupperas de i tre kategorier – varianter av intresse (VOC), Varianter av intresse eller Varianter under utredning (VOI) och Varianter under övervakning. Denna gruppering av undervarianter är baserad på bevis relaterade till överföringsförmåga, immunitet och infektionens svårighetsgrad.
- Varianter av oro (VOC)
Varianterna av bekymmer (VOC) har ett tydligt samband med ökningen av överföringsförmåga eller virulens eller minskning av effektiviteten av alla folkhälsoåtgärder, såsom effektiviteten av vacciner som för närvarande används.
WHO-märkning | Härstamningar | Land som först upptäcktes (gemenskap) | År och månad upptäcktes först |
alfa | F.1.1.7 | Storbritannien | september 2020 |
beta | F.1.351 | Sydafrika | september 2020 |
Gamma | P.1 | Brasilien | december 2020 |
Delta | F.1.617.2 | Indien | december 2020 |
- Varianter av intresse eller varianter under utredning (VOI)
Varianterna av intresse eller varianter under utredning (VOI) är kända för att ha genetiska förändringar som kan påverka dess överföringsförmåga, virulens eller effektivitet av folkhälsoåtgärder och har identifierats orsaka betydande överföring i samhället.
WHO-märkning | Härstamningar | Land som först upptäcktes (gemenskap) | År och månad upptäcktes först |
Eta | F.1.525 | Nigeria | december 2020 |
Iota | F.1.526 | USA | november 2020 |
kappa | F.1.617.1 | Indien | december 2020 |
Lambda | C.37 | Peru | december 2020 |
- Varianter under övervakning
Varianter under övervakning upptäcks som signaler och det finns indikationer på att de kan ha egenskaper som liknar en VOC men bevisen kan vara svag. Därför övervakas dessa varianter ständigt för eventuella förändringar.
WHO-märkning | Härstamningar | Land som först upptäcktes (gemenskap) | År och månad upptäcktes först |
F.1.617.3 | Indien | februari 2021 | |
A.23.1+E484K | Storbritannien | december 2020 | |
Lambda | C.37 | Peru | december 2020 |
B.1.351+P384L | Sydafrika | december 2020 | |
B.1.1.7+L452R | Storbritannien | januari 2021 | |
B.1.1.7+S494P | Storbritannien | januari 2021 | |
C.36+L452R | Egypten | december 2020 | |
AT.1 | Ryssland | januari 2021 | |
Iota | F.1.526 | USA | december 2020 |
Zeta | P.2 | Brasilien | januari 2021 |
AV.1 | Storbritannien | mars 2021 | |
P.1+P681H | Italien | februari 2021 | |
B.1.671.2 + K417N | Storbritannien | juni 2021 |
Denna gruppering är dynamisk, vilket innebär att undervarianterna kan tas bort från en grupp eller inkluderas i vilken grupp som helst beroende på förändringen i bedömningen av hot vad gäller överföring, immunitet och infektionsgrad.
Ironiskt nog verkar utvecklingen av SAR-CoV-2 för närvarande vara en pågående process. Går av naturen av detta virus, så länge det finns överföring bland människor kommer det att finnas replikationsfel och mutationer. Någon mutant eller variant kan övervinna selektionstrycket för att bli mer smittsam och virulent eller undkomma immunsvar för att göra vaccinet mindre effektivt. Möjligen kommer många fler varianter att upptäckas i sinom tid i områden med högre överföring. Minimering av överföring och konstant övervakning är nyckeln till inneslutningsstrategier.
***
Källor:
- Prasad U., 2021. Nya stammar av SARS-CoV-2 (den virus ansvarig för covid-19): Kan strategin "neutraliserande antikroppar" vara ett svar på snabb mutation? Vetenskaplig europeisk. Upplagt 23 december 2020. Tillgänglig online på http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- WHO, 2021. Spårning av SARS-CoV-2-varianter. Tillgänglig online på https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. SARS-CoV-2-varianter av oro från och med den 8 juli 2021. Tillgänglig online på https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***