Hög ålder och komorbiditeter är kända för att vara högriskfaktorer för covid-19. gör det genetisk smink predisponerar vissa människor gör dem mer mottagliga för svåra symtom? Omvänt, gör genetisk sammansättning det möjligt för vissa människor att ha medfödd immunitet vilket gör dem immuna mot COVID-19, vilket innebär att sådana människor kanske inte behöver vaccin. Att identifiera personer med genetisk mottaglighet (genom analys) kan ge en mer effektiv personlig/precisionsmedicinsk strategi för att bekämpa denna pandemi och andra högbelastningssjukdomar som cancer.
Covid-19 är känt för att oproportionerligt påverka äldre och personer med komorbiditeter, men det verkar finnas ett annat mönster. Tydligen är vissa människor det genetiskt mer benägna och benägna att utveckla allvarliga livshotande symtom 1 som indikeras i de rapporterade fallen som tre bröder i liknande åldersgrupp (som levde separat och var normala hälsomässigt) som dukade under för covid-19 2. Denna lilla grupp människor lider av hyperinflammation, klinisk försämring och multipel organsvikt orsakad på grund av utveckling Cytokinstorm (CS) där Interleukin-6 (IL-6) är en central mediator. Två vanliga genpolymorfismer som predisponerar för hyperinflammation är familjär medelhavsfeber (FMF) och glukos-6-fosfatdehydrogenas (G6PD) brist som i kombination med fetma ökar risken ytterligare 3.
En systematisk översikt kopplar känslighet för genetisk varianter av immunsvarsgener. Fyrtio gener visade sig vara associerade med känslighet och 21 av dessa gener hade samband med utveckling av allvarliga symptom 4. En annan studie stöder uppfattningen att ACE2-genen polymorfism bidrar till mottaglighet för covid-19 5. Viruset som är ansvarigt för COVID-19 använder det angiotensinomvandlande enzym 2 (ACE2)-receptorproteinet som finns på cellytan för att komma in i cellen. Varje variation i ACE2-genen skulle ha stor betydelse för predisposition för covid. Rollen som värd-genetik i känslighet för covid-19 undersöks på nivån av strukturella varianter (SV) i en studie som nyligen rapporterats i preprint av Sahajpal NS, et al. I denna studie utförde forskarna genomanalys på 37 svårt sjuka covid-19-patienter. Denna patientcentrerade undersökning identifierade 11 stora strukturella varianter som involverar 38 gener med en potentiell roll i utvecklingen av allvarliga symptom på COVID-19 6.
Den snabbt växande kunskapsbasen om rollen som värd-genetik in Covid-19 sjukdomsprogression kan indikera lämplig förskjutning av fokus mot riktad strategi för förebyggande och behandling av covid-19. Det kan vara möjligt att tänka på just riktade insatser till unika genetisk-sminkning av individer 7. De personliga, exakta behandlingarna eller interventionerna skulle dock kräva genomanalysdata på individnivå. Det kan finnas problem med integritet att ta itu med, men i det långa loppet kan detta visa sig vara mer kostnadseffektivt också.
För närvarande finns det några kommersiella organisationer som tillhandahåller personliga tjänster som täcker grundläggande hälsoanlag för individer. Det skulle dock behövas mer organiserade insatser inom den offentliga sektorn för att bygga kunskapsbasen och infrastrukturen för att personlig precisionsmedicin ska bli verklighet. GEN-COVID multicenterstudie 8 som syftar till att härleda fenotypiska och genotypiska data på individuell nivå genom biobanker och hälsojournaler för att göra data tillgänglig för Covid-19 forskare över hela världen är ett steg framåt i denna riktning.
***
Referenser:
- Kaiser J., 2020. Hur sjuk kommer coronaviruset göra dig? Svaret kan finnas i dina gener. Vetenskap. Publicerad 27 mars 2020. DOI: https://doi.org/10.1126/science.abb9192
- Yousefzadegan S., och Rezaei N., 2020. Fallrapport: Död på grund av COVID-19 i Three Brothers. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. Volym 102: Nummer 6 Sida(r): 1203–1204. Publicerad online: 10 april 2020. DOI: https://doi.org/10.4269/ajtmh.20-0240
- Woo Y., Kamarulzaman A., et al 2020. A genetisk predisposition för Cytokine Storm vid livshotande COVID-19-infektion. OSFPreprints. Skapad: 12 april 2020. DOI: https://doi.org/10.31219/osf.io/mxsvw
- Elhabyan A., Elyaacoub S., et al, 2020. Rollen som värd genetik i känslighet för allvarliga virusinfektioner hos människor och insikter i värdgenetik för allvarlig covid-19: A systematisk granskning, Virus Research, Volym 289, 2020. Tillgänglig online 9 september 2020. DOI: https://doi.org/10.1016/j.virusres.2020.198163
- Calcagnile M. och Forgez P., 2020. Molekylär dockningssimulering avslöjar ACE2-polymorfismer som kan öka affiniteten för ACE2 med SARS-CoV-2 Spike-proteinet. Biochimie volym 180, januari 2021, sid 143-148. Tillgänglig online 9 november 2020. DOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2020.11.004
- Sahajpal NS, Lai CJ, et al, 2021. Värdgenomanalys av strukturella variationer genom Optical Genome Mapping ger kliniskt värdefulla insikter om gener som är inblandade i kritiska immun-, virusinfektions- och virusreplikationsvägar hos patienter med svår covid-19. Förtryck medRxiv. 8 januari 2021. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.01.05.21249190
- Zhou, A., Sabatello, M., Eyal, G. et al. Är precisionsmedicin relevant i en ålder av covid-19? Genet Med (2021). Publicerad: 13 januari 202. DOI: https://doi.org/10.1038/s41436-020-01088-4
- Daga, S., Fallerini, C., Baldassarri, M. et al. Att använda ett systematiskt tillvägagångssätt för biobanking och analysera kliniska och genetisk data för att främja covid-19-forskningen. Eur J Hum Genet (2021). Publicerad: 17 januari 2021. https://doi.org/10.1038/s41431-020-00793-7
***
